BVTS - Darbo grupės
Biotermodinamikos ir vaistų tyrimų skyrius sukurtas 2006 metais, vietoj buvusios Rekombinantinių baltymų laboratorijos. Po Biotechnologijos instituto statuso pasikeitimo 2010 m. pabaigoje laboratorija pervadinta į skyrių. Skyrius kuria naujus cheminius junginius, pasižyminčius priešvėžiniu poveikiu. Susintetintų medžiagų kartu su gamtoje aptinkamomis, efektyvumas įvertinamas struktūrinės biotermodinamikos ir molekulinio modeliavimo metodais.
Skyriaus darbuotojai pagal savo tiriamąją veiklą dirba penkiose darbo grupėse:
Molekulinės biologijos ir ląstelės biologijos grupė Vadovaujama dr. Jurgitos Matulienės, ši grupė klonuoja baltymų- taikinių genus, ekspresuoja juos E. coli, vabzdžių arba žinduolių ląstelėse, grynina pakankamus aktyvių baltymų kiekius tolimesniems jungimosi su sintetiniais ligandais biotermodinaminiams matavimams. Vykdomi keli projektai su mutantais ir baltymų domenų konstruktais. Priešvėžinio aktyvumo įvertinimui tiriamas junginių poveikis žmogaus vėžio ląstelėms. Dr. Vilma Petrikaitė taip pat atlieka junginių bandymus su pelių ksenograftais. Ši tyrėjų grupė bendradarbiauja su Imunologijos ir ląstelės biologijos skyriumi kuriant antikūnius ir diagnostikos žymenis. |
Organinės sintezės grupė Vadovaujama dr. Virginijos Dudutienės, organinės sintezės grupė gamina junginius, kurie gebėtų jungtis prie karboanhidrazių bei kitų baltymų- vaistų taikinių. Junginiai pasirenkami pagal panašią cheminę struktūrą, taip pat šios struktūros kuriamos kompiuterio pagalba. Junginiai apibūdinami ir jų švarumas įvertinamas BMR ir HPLC-HRMS metodais |
Biofizikos grupė Dr. Daumanto Matulio vadovaujama biotermodinamikos grupė biofizikiniais metodais tiria baltymų- ligandų sąveiką. Tai izoterminė titravimo kalorimetrija (ITC) ir terminio poslinkio metodas (DSF, ThermoFluor®), slėgio poslinkio metodas ir įprasti fermentų aktyvumo matavimai. Grupė nustato tikrąsias laisvosios Gibso energijos, entalpijos, entropijos vertes, šilumines talpas ir jungimosi tūrio pokyčius. Įvertina baltymų stabilumo pokyčius veikiant įvairiais gamtiniais ir sintetintais junginiais. |
Molekulinio modeliavimo grupė atlieka in silico dokinimą didelėse cheminių junginių bibliotekose. Taip pat analizuoja susintetintų junginių- baltymo kompleksų struktūras, gautas bendradarbiaujant su Sauliaus Gražulio grupe iš Baltymų-nukleorūgščių sąveikos tyrimų skyriaus. Molekulinis modeliavimas dažnai padeda nuspėti naujus junginius, pasižymesiančius didele jungimosi tikimybe. Grupė vysto programinę įrangą, galinčią prognozuoti ligandų jungimosi prie baltymų energetiką, žinant tik baltymo molekulės struktūrą. |
|
Biotermodinamikos ir vaistų tyrimų skyrius bendradarbiauja su: Medicinos technologijos institutas, Tampere universitetas, Suomija. Narystė Lietuvos biofizikų draugija |