Baltymų-nukleorūgščių sąveikos tyrimų skyrius

Skyriaus vedėjas:


Prof. Dr. Virginijus Šikšnys

Tel. +370-5-2234354
Fax. +370-5-2687009
E-mail:

Mokslo darbuotojai(-os):

Dr. Giedrius Gasiūnas
Dr. Saulius Gražulis
Dr. Elena Manakova
Dr. Giedrius Sasnauskas
Dr. Arūnas Šilanskas
Dr. Tomas Šinkūnas
Dr. Giedrė Tamulaitienė
Dr. Gintautas Tamulaitis
Dr. Mindaugas Zaremba

Doktorantai(-ės):

Andrius Merkys, MSc
Tautvydas Karvelis, MSc
Miglė Kazlauskienė, MSc
Georgij Kostiuk, MSc
Inga Songailienė, MSc
Antanas Vaitkus, MSc
Paulius Toliušis, MSc
Evelina Zagorskaitė, MSc

Studentai(-ės):

Greta Bigelytė, BSc
Gediminas Drabavičius, BSc
Marius Jatautas
Vykintas Jauniškis
Rokas Grigaitis, BSc
Kotryna Kauneckaitė, BSc
Marius Makaras
Rūta Masiulytė
Miglė Mikutėnaitė, BSc
Irmantas Mogila, BSc
Dalia Smalakytė, BSc
Donata Tuminauskaitė
Tomas Urbaitis, BSc

Laborantai(-ės):

Mantvyda Marija Grušytė
Ana Tunevič
2016 BNSTS

Bendra tyrimų apžvalga

Visos gyvybės formos nuo bakterijų iki žinduolių yra potencialūs virusų taikiniai. Bakterijų virusai (bakteriofagai) gali sunaikinti ištisas bakterijų populiacijas. Evoliucijos eigoje bakterijos sugebėjo išlikti sukurdamos gynybos sistemas, kurios saugo ląsteles nuo bakteriofagų ir svetimų nukleorūgščių patekimo. Kadangi bakteriofagai gali daugintis tik ląstelėje, jie kinta, ieškodami būdų kaip įveikti ląstelių gynybos barjerus, o bakterijos priverstos kurti naujas apsaugos sistemas.

Daug žmogui naudingų produktų, pvz., pieno produktai, bioaktyvūs junginiai ir vaistai, yra gaminami panaudojant bakterijas. Tokioje gamyboje bakteriofagų infekcijos yra labai pavojingos, kadangi jos gali sunaikinti visą bakterijų populiaciją, todėl pramonėje yra reikalingi bakterijų kamienai, turintys efektyvias antivirusinės apsaugos sistemas. Norint sukurti tokius bakterijų kamienus laboratorijoje, reikia suprasti, kaip veikia antivirusinės apsaugos sistemos.

Mūsų skyrius tiria fermentus ir jų kompleksus, kurie yra atsakingi už bakterijų apsaugą nuo svetimų nukleorūgščių. Labiausiai mus domina restrikcijos endonukleazių bei CRISPR molekulinio aparato struktūra ir veikimo mechanizmas. Tyrimams naudojame rentgenostruktūrinę analizę, mutagenezę, biocheminius ir biofizikinius tyrimo metodus.

Projektai

CRISPR
Restrikcijos endonukleazės
COD

Publikacijos

2011 — 2016

Informacija apie skyrių:

Department of Protein-Nucleic Acids Interactions